醫學檢驗室選擇使用高通量基因定序進行細菌分型鑑定時，下列敘述何者最正確？

題目

醫學檢驗室選擇使用高通量基因定序進行細菌分型鑑定時，下列敘述何者最正確？ A. 短片段基因定序產生的通量大於長片段基因定序，因此細菌分型只能使用短片段定序法 B. 細菌基因序列具有高GC比的特性，因此不建議使用高通量基因定序進行細菌分型 C. 短片段基因定序可以完成100%的細菌全基因組序列組裝（assembly） D. 單分子即時定序法（single molecule real-time sequencing）不受細菌基因組中的高GC比區域的影響

官方答案

• 答案：D. 單分子即時定序法（single molecule real-time sequencing）不受細菌基因組中的高GC比區域的影響

解析

高通量定序分為短片段（如 Illumina）與長片段（如 PacBio SMRT、Nanopore）兩種。短片段定序通量高、成本低，但細菌基因組常含重複序列與高GC區，短片段難以跨越這些區域，因此無法達成完整的組裝，故 A、C 不正確；B 也不正確，因為高GC比只會影響部分建庫與擴增效率，並不是高通量定序的禁忌。SMRT 定序屬於單分子即時讀取，不需 PCR 擴增，較不會因高GC區而產生擴增偏差或定序中斷，適合細菌全基因組定序與分型，故選 D。

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官方資料

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