由全轉錄體定序（whole transcriptome sequencing）產出用於敘述各個基因產物豐度的 fragments perkilobase of…

題目

由全轉錄體定序（whole transcriptome sequencing）產出用於敘述各個基因產物豐度的 fragments perkilobase of transcript per million mapped reads（FPKM）值，最不會受到下列那個因子的影響？ A. 定序基因產物的長度 B. 可正確比對至定序基因產物的讀長數（mapped reads） C. 定序讀長 D. 定序深度（reading depth）

官方答案

• 答案：C. 定序讀長

解析

FPKM（Fragments Per Kilobase of transcript per Million mapped reads）公式為：FPKM = (10^9 × C) / (N × L)。C 為比對到該基因的片段數，N 為總比對片段數（百萬為單位），L 為外顯子總長度（kb 為單位）。公式中已以 L（基因長度）與 N（定序深度/總 mapped reads）進行標準化，因此基因長度（A）與定序深度（D）不會影響 FPKM 值；mapped reads 數（B）直接為分子 C，影響極大。定序讀長（read length，C）不在公式變數中，僅影響比對品質與覆蓋均勻度，但不直接改變 FPKM 計算值，故影響最小。

AI 參考解析（推得答案已與官方答案比對一致），非官方公告內容，僅供備考參考。

官方資料

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