以基因定序法進行16S rRNA 基因序列比對之結果，若要達到菌種（species）層級之鑑定，下列何者錯誤？

題目

以基因定序法進行16S rRNA 基因序列比對之結果，若要達到菌種（species）層級之鑑定，下列何者錯誤？ A. 大於95%序列相似度，才可判定為同種（species） B. 若序列比對結果最高及第二高相似菌種序列，彼此相似度的差異性小於0.5%，則應使用其他試驗進行菌種之確認 C. 以標準參考菌株比對為最佳 D. 可序列比對之基因長度，應至少500 個核苷酸以上

官方答案

• 答案：A. 大於95%序列相似度，才可判定為同種（species）

解析

以16S rRNA基因序列進行菌種（species）層級鑑定，國際與臨床微生物指引建議序列相似度須達約99%（至少97～99%）方可判定同種；選項A所稱「大於95%即可判定為同種」過於寬鬆，95%僅約屬屬（genus）或更高層級，故A錯誤（最不適當）。B正確：最高與次高相似菌種差異小於0.5%時，應輔以生化或其他分子試驗確認；C正確：以標準參考菌株（type strain）比對最佳；D正確：比對長度宜至少500個核苷酸（bp）以上以提高鑑別力。

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官方資料

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